Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snw1Q9CSN1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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