Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Nicn1Q9CQM0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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