Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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