Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms