Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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