Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cep41Q99NF3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms