Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mrpl27Q99N92 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mrpl27Q99N92 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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