Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PtprtQ99M80 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms