Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp16Q99LG0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms