Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RtcbQ99LF4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms