Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms