Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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