Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pacsin3Q99JB8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms