Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms