Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smim11aQ99J19 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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