Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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