Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms