Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms