Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms