Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usb1Q91W78 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usb1Q91W78 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usb1Q91W78 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usb1Q91W78 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usb1Q91W78 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms