Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt79Q8VED5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms