Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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