Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms