Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Vmn1r188Q8K3N2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r188Q8K3N2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r188Q8K3N2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r188Q8K3N2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r188Q8K3N2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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