Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms