Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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