Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms