Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CopaQ8CIE6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms