Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tshz3Q8CGV9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms