Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms