Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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