Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snx8Q8CFD4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snx8Q8CFD4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Snx8Q8CFD4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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