Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccdc28aQ8CEI3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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