Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc38Q8CDN8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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