Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nhlrc3Q8CCH2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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