Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms