Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf12Q8C8K3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms