Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q8C708 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q8C708 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8C708 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms