Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ctdsp2Q8BX07 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ctdsp2Q8BX07 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ctdsp2Q8BX07 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ctdsp2Q8BX07 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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