Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm4aQ8BW72 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kdm4aQ8BW72 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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