Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc12Q8BW49 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms