Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx17Q8BVL3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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