Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ssc5dQ8BV57 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssc5dQ8BV57 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms