Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms