Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tubgcp5Q8BKN5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tubgcp5Q8BKN5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp5Q8BKN5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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