Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ubash3bQ8BGG7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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