Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg2bQ80XK6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg2bQ80XK6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms