Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms