Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc2aQ7TSC1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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