Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms